
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物体 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探析最终结果
学习拜谱生物蜡烛燃烧实验不断地冷库的时间段延缓的时间牛羊肉的洛氏氏硬度、持反击式水轮机、光色、徘徊铁水分含量的、ROS、脂质过硫化物、MDA、GSH和GPX4平行来开展腿部肌肉组建体细胞系的铁伤亡的状态。結果彰显,冷库的时间段延缓的时间后,牛羊肉的洛氏氏硬度在第3天和第6天重要越来越低;持水业务能力调低;外表颜色变深,丢掉光滑,鲜蓝色就来为暗蓝色。不仅如此,徘徊铁、几丁质酶氧和MDA的水分含量的重要多,体细胞系凋亡率重要提升。 科学研究技术人员转化成区别要在冷藏室保存日子的腹肌试品的脂肪酸酶质,进而来进行SDS-PAGE浅析一下,脂肪酸酶质条带在区别時期分布不均光滑且类似的(图1a)。按照其脂肪酸酶在区别试品中的描述情况发生,浅析一下发觉相同组试品的中个数相当于相同标准(图1b),阐明腹肌试品脂肪酸酶质具有着充分的组内类似的性和组间对比分析性。 球氨基酸组学共评定出1996种球氨基酸。以B0为对比组,建立B1、B2、B4和B6中的球淀粉酶实施异同表示具体分折,共评定到376个DEPs。将火山图可视化效果,并表明FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05这两个规则具体分折DEP。后果如1c-f如图是,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别评定出22、33、73和140个DEPs,但其中别上涨6、11、32和87个,下跌16、22、41和5俩。聚类分析技巧风险评估了各个冷冻一阶段健身全身肌肉公司中球氨基酸的表示,后果体现健身全身肌肉球淀粉酶表示异同逐渐放置周期的添加而添加(图1g)。
图1| 不同的冷冻冷藏事件的腹肌合格品核蛋白质含量组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 与众不同保鲜时间段的肌群产品的样品差距血清讲解(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁死亡者血清肽的PRM参考值介绍(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 依据KEGG含有的差异把你想表达出来蛋清的铁身故机制化(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物工程提供了TMT定量分析球膳食纤维组学技术工艺水平业务,拜谱生物学已科研开发实现并构建了落实成熟稳重的转录组学、球球蛋白组学、细胞代谢组学或是几组学协同护肤品技术工艺水平业务指标体系,欢迎致电咨询!
参考价值论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.