
2024年9月由常州农牧业大家张万刚副教授技术团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物体为该研究提供了亚硝基化淡化组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文翻译网站标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
杂志期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202四年决定指数:5.7
说出时长:2024年9月
大家机关单位:南京农业大学
实验素材:蛋白
拜谱具备高技术:亚硝基化修饰组学
系统路径:
一、探究导致
01.Caspase-3活性酶
迄今为止尚不模糊NO对caspase-3的调节用能不能归因于NO介导的S-亚硝基化,有差异质量浓度梯度方向的GSNO充当外源性NO供应信息,以诱导型caspase-3的离体S-亚硝基化。结杲发现,与都没有GSNO的组相信,100、200和400μM GSNO组的caspase-3活力性特殊变低(图1),与原先新闻稿一样的。GSNO整理变低caspase-3活力性的自身因素仍急待具体分析。
图1 多种氨水浓度的GSNO外理对caspase-3渗透性的关系
02.Caspase-3的S-亚硝基化的情况
探析Caspase-3的亚硝基化数量,以阐发GSNO对Caspase-3的反映性。经GSNO工作后,论文的检测到caspase-3蛋清S-亚硝基化的强度增添(图2)。这类的结果得出结论,外源性GSNO培养计划可成功的英文引诱caspase-3的休外S-亚硝基化。这令难以相信的是,在无GSNO会出现的差表组中论文的检测到一款变弱的S-亚硝基化带,这得出结论caspase-3可能有内源性的S-亚硝基化。显然,本探析中caspase-3的S-亚硝基化数量较高,而caspase-3的亲水性减轻,这与开始之前的探析一直。既使,caspase-3的特情人S-亚硝基化修饰语位点尚不清,还还要进那步的找寻。
图2 GSNO清理对caspase-3S-亚硝基化横向的干扰
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化呈现组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的回文编码序列。白色标签的回文编码序列表述S-亚硝基化肽,鲜红色标签的C表述S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱仪
04.S-亚硝基化Caspase-3分解结血清
结球核球蛋清质酶看作本身重点的肿瘤组织骨架球核球蛋清质酶,在长期保持肌肿瘤组织框架的框架详尽性和做收缩性几个方面起着重于点用途,研发S-亚硝基化caspase-3对结球核球蛋清质酶挥发的敏理智性包括重点目的。与Std(未用胱天球核球蛋清质酶酶-3和GSNO孵育的初使肌人造棉纤维球核球蛋清质酶)组相比较,0 μM GSNO组(肌原人造棉纤维和caspase-3的孵育,无GSNO)的详尽结球核球蛋清质酶含锌量强势减少,显示caspase-3对结球核球蛋清质酶包括内在的的球核球蛋清质酶油脂水解性能。在GSNO孵育后,详尽结球核球蛋清质酶的含锌量很深加剧(P < 0.05)。另外,当GSNO盐浓度提升时,详尽结球核球蛋清质酶的含锌量维持调涨(P < 0.05)(图5)。这一种出现 表达,SNO呈现的caspase-3以能力依靠的方法抑制性结球核球蛋清质酶的挥发。
图5.S-亚硝基化caspase-3生物降解结蛋白质
05.S-亚硝基化Caspase- 3化学降解肌钙淀粉酶-T
肌钙蛋清酶-T (TnT)是原肌球蛋清酶缓解担任腿部肌肉抽缩的细条的有必要肌原氯纶蛋清酶。TnT的溶解特性是验测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化标准下,caspase-3对TnT的溶解时候如图已知6提示,与Std组(不标caspase-3和GSNO的肌原氯纶)不同之处,caspase-3组中30 kDa TnT段落相关系数提高,揭示caspase-3直接参与了TnT的溶解,前者,caspase-3与GSNO的孵育致使30 kDa TnT增涨。在100和200 μM GSNO组之中沒有验测到特别的差异性(P > 0.05),而当GSNO的有机废气浓度满足400 μM 时,该段落相关系数减小(P < 0.05)。这样的看见揭示了SNO装饰的caspase-3对TnT溶解的减弱帮助。结蛋清酶和TnT是caspase-3的神经敏感底物,而GSNO处理缩减caspase-3的特异性可不可以致使肌原氯纶蛋清酶溶解成度缩减。总而言之阐明,NO促进的S-亚硝基化可不可以使用装饰半胱氨酸残基来缓解caspase-3的特异性,因而进每一步印象其对结蛋清酶和TnT的蛋清酶水解反应效果,以此印象牛羊肉茶叶品质。
图6. S-亚硝基化caspase- 3溶解肌钙蛋白质-T
二、总结
本的研究为了更好地探析S-亚硝基化对caspase-3体现的作用简述随着对鸡肉肌原植物化学纤维身体化学降解的作用。血清S-亚硝基化行体现caspase-3的半胱氨酸残基,最终得以促使caspase-3吸附性较低,进1步控制了其对鸡肉肌原植物化学纤维血清的血清淀粉水解效率。三、拜谱总结ppt
科研采取了酶活测试,亚硝基化体现组学解析,WB等的检测行为,知道球球蛋清S-亚硝基化能能体现caspase-3的半胱氨酸残基,这致使了caspase-3可溶性的减少,相结那步减弱了其对羊肉肌原仟维球球蛋清的球球蛋清淀粉水解专业能力。本科研为表示球球蛋清质亚硝基化对色泽的调空规则展示好几回个新的第一视角。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的蛋白酶酶质组学、呈现蛋白酶酶质组学、分解组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸编产品设备,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺过酸、total氧化反应恢复、游离态巯基,欢迎大家咨询!
借鉴资料:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663