草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿设备性里比较常见的急病之中。肾进行中CaOx晶胞过达到饱和状态沉积物会因此会导致肾小管内部拉伤和凋亡，因此因此会导致肾结石的组成。短链蛋白质多酸由消化道内好氧池有害菌进行发酵膳食结构食物纤维带来，不但在产品局部消化道第一道防线中表现的的功效，且在设备性技术水平上也表现重要的的的功效。另外，丁酸是最多种多样的短链蛋白质多酸，具备着免疫检测抑制性和免疫检测抑制性的的功效,本探索研究方案丁酸对CaOx肾结石的的的功效名词解释潜在性靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山卫生院泌尿整形外科吴忠教援、周子健医学博士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠博土生导师、周子健博土在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱菌物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了电脑网络药理学学服务质量，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

内容分类：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 用户单位名称：华山医院医生 研发群体：大鼠、HK-2细胞核 分组进行讯息：参考组（Con）、三维模型组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱出具系统：网咯药理学学探测

总体目标流程图

研究探讨毕竟

深入分析分析员第一步实现大鼠类别，实现生理上生化学的指标和策划 疾病学脱色等深入分析分析伎俩发展丁酸能够 极大减少CaOx类别大鼠肾CaOx晶胞的确立和断裂，可以改善CaOx类别大鼠的炎症病变断裂和硫化的元素的过度紧张体现。因此，丁酸还可控制草酸诱导性的HK-2血内部断裂、硫化的应激性和血内部凋亡。 为蜡烛燃烧实验丁酸构成和靶遗传DNA遗传遗传互联网统计动态数据报告，设计员从PubChem读取丁酸和丁酸酯的二维和三维空间构成（图1A）。能够PharmMapper统计动态数据报告库和Uniprot统计动态数据报告库处理后共淘汰出11九个丁酸靶遗传DNA遗传遗传供进几步研究了解。将遗传DNA遗传遗传列表框接入STRING统计动态数据报告库，对其进行PPI互联网统计动态数据报告研究了解。Cytoscape给予了顺序排列的前20的核心靶遗传DNA遗传遗传的详细深入分析互联网统计动态数据报告图，核心包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这一些核心遗传DNA遗传遗传与互联网统计动态数据报告中的其余遗传DNA遗传遗传均特征出需的相应性，情况说明这一些遗传DNA遗传遗传或许会展现着推进用。GO和KEGG研究了解反映了丁酸核心遗传DNA遗传遗传的相应路线和微植物学功能模块（图1C）。核心遗传DNA遗传遗传核心与类固醇畅快素类对答、阳极防氧化应激性状态对答、活力性酶氧人体细胞对类固醇畅快素类畅快的现象已经对酸碱性有机化学材质的现象管于。上述讲到归结，这一些核心遗传DNA遗传遗传核心陆续参与了阳极防氧化应激性状态和对活力性酶氧的微菌物现象工作，是肾结石导致新机制中至关很关键的路线，这发现丁酸或许会在肾结石中展现很关键用。

图1| 丁酸成分与靶基因组数据网络概述(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进第一步思考丁酸对CaOx肾结石确凿切靶表观遗传，探析工作专业人工管理凭借GEO的数据报告库查询对GSE73680中安全对应与CaOx肾结石糖尿病患有的表观遗传不同之处展开了探析。对应组与CaOx结石糖尿病患有的有明显性不同之处呈现表观遗传（DEGs）检测标准规范为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个表观遗传展开有明显不同，其中的3379个（89.4%）表观遗传呈现上涨，404个（10.6%）表观遗传呈现再降（图2A）。对DEGs展开聚类分析算法定量分析，热图表明了前10个被选中DEGs的二维分块聚类分析算法结构特征（图2B）。自后，探析工作专业人工管理经由GeneCards的数据报告库查询人工工资鉴定结论了370个机会与CaOx肾结石相应的表观遗传，综合排名前20位的预计表观遗传和其相应性评判图甲2C右图。要想发现丁酸治療CaOx肾结石的关键所在靶点，探析工作专业人工管理将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石相应表观遗传加工处理到新一个Venn图。决定，CYP2C9被肯定为丁酸的影响CaOx肾结石的潜在性靶点(图2D)。虽然，探析工作专业人工管理还展开了丁酸与CYP2C9的氧分子交接，CYP2C9的6个氨基酸等残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸彼此功效，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在使用网络信息药理学学推测CYP2C9是丁酸影向CaOx肾结石的靶遗传基因后，学习人还能够神经元科学试验否认了CYP2C9可减小草酸诱导性的HK-2神经元的ROS情况、真菌感染直接损伤和凋亡。

图2| 大部分据库联手解析预计CYP2C9是丁酸使用于CaOx肾结石的靶遗传基因

调查然而

本理论研究先出现 丁酸在离体和胃中均能阻止CaOx肾结石建模 的脱色应激状态反应和感染病变损坏，马上又根据无线网络信息药学学学筛分收获丁酸直接影响CaOx肾结石的内在靶点——CYP2C9，最后的根据内部膜实验操作印证CYP2C9在草酸盐引发的HK-2内部膜ROS品质、感染病变损坏和凋亡。他们出现 取决于丁酸或许根据阻止CYP2C9来阻止CaOx肾结石的脱色应激状态反应，消减感染病变损坏。这一种时中拜谱动物出示了无线网络信息药学学学新技术设备的服务保障，与此同时拜谱动物可不断提高成长期逐步完善的基因组组学、蛋清质组学、代谢转化组学等几组学服务保障及新技术设备的服务保障，欢迎词拨打咨询了解。！ 学习文献资料：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.