
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抗体阳性聚集MHC举例说明结合实际肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫细胞肽编码序列各类翻譯后突显内容,提高基因测序的真实度,并采用De novo重新测序技术性,不依赖现有数据库,更快通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且雄厚的数据报告研究知识为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递肉瘤抗原的渠道
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案列剖析
01 规则研究方案
软文标题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
刊出杂质:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)就是一种核输入蛋白酶,在良性肿瘤中常过描述,做以为良性肿瘤发现的驱动安装基本要素。迄今为止,靶向用量XPO1的小碳原子正被充当临床药学防癌用量。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫细胞肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 一类来自XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 淋巴肿瘤-天然免疫进行治疗
原创文章小题目:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
公布期刊杂志:Nature Communications IF:16.6 2023
恶劣胸膜间皮瘤(MPM)是种生存率不良的的侵入性恶性肿瘤。这样主要的改善方案怎么写匮乏效用,这样十分困难需用新的改善方法。由于其T神经元浸润性,编辑选用MPM是个比较适合的改善性肠癌预防针的阶段目标。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用应用于质谱的免役肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 梭形细胞肿瘤胸膜间皮瘤免役肽组学的检测
03 杆菌mRNA预防针的开发
软文问题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
发稿期刊:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过因为质谱的免疫系统肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌感化的Hela細胞和HCT-116細胞中签别MHC I呈递的抗原肽。
拜谱总结ppt
天然免役癌神经元抗体性肽组学是核苷酸质组学的1个最快趋势的结点,它针对于设计天然免役癌神经元抗体性系統中由大部分安排安排相溶性复合型体(MHC)或人类白上皮癌神经元抗原(HLA)原子呈递的天然免役癌神经元抗体性肽。这天然免役癌神经元抗体性肽是上皮癌神经元面上呈递的肽段,可被T上皮癌神经元甄别,得以引起天然免役癌神经元抗体性表现。应用场景质谱的天然免役癌神经元抗体性肽组学已拥有签定MHC核苷酸呈递肽的金规格方式 ,可随便签定各种生物学和病症模式下各种安排安排和上皮癌神经元结构类型中的天然免役癌神经元抗体性肽组,如企业瘤或艾滋病毒沾染的上皮癌神经元。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的蛋白质组学、代谢转化组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的天然免疫肽组验测服务项目,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,可精确且可以带来了抗体力肽队列,感觉非常多非一般抗体力肽,层层抓落实筛分出能信新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
可以参考文章
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y