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Int J Mol Sci | m6A甲基化修饰对糖尿病小鼠认知功能障碍的调控机制

发布时间:2024-08-02
N6-甲基腺苷(m6A)是真核海洋生物技术mRNA中偏极为重要的转录后掩盖,在真核海洋生物技术的病和女性生理时候中起着至关极为重要的的作用。高血糖的认知困难也是种不不可逆转的中枢装置精神装置退行性病,当下进步.切体系暂时无法截然体现了,还有由于缺乏有效地的中药治疗和中药治疗有效途径。

2024年2月6日,北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱海洋生物为其提供m6A甲基化分析一下技能服务于,为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。

优秀文章公司名称:Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice(Int J Mol Sci.,IF=6.2,2024.2)

投资者机关单位:北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院

设计食材:小鼠脑组织

拜谱出具方法:m6A甲基化(MeRIP-seq)

引言图:

图1| 小结图(图源:Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)

探究报告

1.DCI小鼠海马中m6A染色体淡化的增加

分折人数先确立了高脂餐饮和认同障碍物(DCI)的小鼠绘图。为不同于剖析组(n = 3)和DCI组(n = 3)中的m6A人类DNA掩盖,分折人数操作MeRIP-seq做好了转录组超范围内的m6A-seq分折。在DCI组的10664个商品代码人类DNA转录物(mRNAs)一共显示剖析组的23714个不叠加的m6A峰。不同于下面,DCI组具体表现出23,754个非叠加m6A峰。这其中,9349个甲基化人类DNA在剖析组和DCI组中叠加(图2)。

图2| 相较比较组和DCl组m6a掩盖dna的维恩图

共司法鉴定出127七个异同甲基化的m6A位点(DMMSs),各举60.88%(778/1278)和39.12%(500/1278)的甲基化前提都重要超出较组。探讨其匀称区前提出现m6A峰匀称区在整RNA中(图3A),并利用其匀称区的转录地域氛围之下五组:5'UTR、3'UTR、转录起止位点地域精彩段落、解除用户名和密匙锁子精彩段落、起止用户名和密匙锁子精彩段落和数字编码序列(CDS)。m6A峰的在3'UTR、CDS和解除用户名和密匙锁子火车站附近重要丰度(图3B)。为了让评诂这类基因组组上m6A淡化的地域,分析成员挑选了有峰注解的地域,并测定方法了这类基因组组上reads的复盖率。在DCI组中,m6A淡化区偏于3'UTR区(图3C)。一切mRNA内的DMMS都被产品定位到脱色体上前评诂其匀称区简介。区别小鼠脱色体的m6A淡化谱区别。

图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的增加

方便抽样检查m6A淡化在DCI小鼠中的生物技术技术学基本功能,钻研人从两个选中择含有DMMS的球核苷酸识别码dna组开始GO和KEGG阐述(图4A)。在GO阐述中,高甲基化dna组在肿瘤组织系膜工作、生物技术技术工作自我调节、催化剂的作用剂的作用亲水性和杂环可挥发物联系中有效生物丰度。KEGG环路阐述表现,高甲基化dna组与T肿瘤组织系膜肾上腺素肾上腺素受体信息环路、小肿瘤组织系膜1.肺癌和RIG-I样肾上腺素肾上腺素受体信息环路关于(图4B)。就低甲基化dna组,GO阐述表现在肿瘤组织系膜工作、新陈代谢工作和联系工作中有效生物丰度可挥发环可挥发物、联系杂环可挥发物和催化剂的作用剂的作用亲水性(图4C)。KEGG环路阐述反映了低甲基化dna组与肥厚性心肌病和Hippo信息环路的联系(图4D)。

图4| 异同甲基化m6A位点的通道丰度

2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq参数的联和定性分析

马上又研究研究拜谱生物将m6A MeRIP-Seq的数据统计统计和原本RNA-Seq的数据统计统计对其进行联和研究,表明163个mRNA,m6A峰和mRNA水准重要发生变化。41种mRNA的m6A和mRNA水准调涨,14种mRNA水准下跌。不但,30个人类表观遗传mRNA表示出调涨,m6A水准下跌,7七个人类表观遗传mRNA表示出下跌,m6A水准调涨(图5A)。最后一个,建设方案打了个个PPI网路来表明163个人类表观遗传编号规则的淀粉酶相互间的拼接(图5B)。

如下图6图甲中,GO和KEGG探讨一下分四组:(1) m6A调涨,mRNA上涨;(2) m6A调涨,mRNA调涨;(3) m6A上涨,mRNA上涨;(4) 遗传DNAm6A上涨和mRNA调涨。在GO探讨一下中,m6A调涨和mRNA上涨的遗传DNA在内部消化吸收全具体步骤、幽香族化学物质生物学合出全具体步骤和RNA消化吸收全具体步骤的调节中更为明显含有。KEGG探讨一下提示 信息,他们遗传DNA在碳水化合物酸消化吸收、小内部肝癌、丙酸消化吸收和异丙醇酸消化吸收中含有。对於m6A调涨和mRNA调涨的遗传DNA,GO探讨一下提示 信息在亚铁构建、亚胺丙氨酸脱羧酶活力酶氧、天冬氨酸1-脱羧酶活力酶氧和内部连接方式拼装负调节中含有;KEGG探讨一下提示 信息在2型胃癌、碳水化合物内部指数信息通道和胰岛素信息通道中含有。在GO探讨一下中,m6A上涨和mRNA上涨的遗传DNA在寡肽构建、谷胱甘肽构建和二硫非金属脱色物物非金属脱色物恢复酶活力酶氧中含有,而在KEGG探讨一下中,这些在柚子酸循环系统法(TCA循环系统法)、丙酸消化吸收和多动物群凋亡中含有。在GO探讨一下中,m6A上涨和mRNA调涨的遗传DNA在胚胎骨骨关节基本特征再次发生、球蛋白激酶活力酶氧激话和NADP消化吸收全具体步骤中含有,在KEGG探讨一下中,m6A上涨和mRNA调涨遗传DNA在新霉素、卡那霉素和感觉神经营养物质指数信息通道中含有。

图5| m6A甲基化与mRNA表达方法的联席研究

图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG概述

拜谱菌物总结ppt

本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变,特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解,可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱菌物提供了m6A甲基化技能产品,拜谱生物体可提供完善成熟的蛋清组学、代谢转化组学、转录组学及及两组学整合產品技术设备保障,欢迎致电咨询!

关联性文献资料:Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.

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